Miten Laske Sequence kattavuus

Väkevöittäminen opiskelu vaatiilaskemista Sekvensointitiedot määrittääkattavuus . Tämä tapahtuu ensisijaisesti geenisekvensseihin laboratorioiden edellyttävät integroitua DNA-näytteen valmisteluun ja esirikastusjakson yhdistämistä . Laskettaessa sekvensointi kattavuus edellyttää muuttujia , jotka sisältävätkeskiarvo sekvensointi kattavuus ,koko kohdennettuja emäkset jarikastamiseen tehokkuutta . Esittävät tämä laskelma tehdään syöttämällä kaikki nämä muuttujiayhtälöön . Ohjeet

1

Kirjoita poisyhtälöstä laskennassa käytettykeskimääräinen sekvensointi kattavuutta . Tämä näyttäähalutun kattavuuden jaettuna keskimääräinen normalisoitu kattavuutta . Joshaluttu kattavuus on 10x ja keskimääräinen normalisoitu kattavuus on 0,2 , niinkeskiarvo sekvensointi kattavuus on 50.
2

Kirjoita poisyhtälöstä laskemisessa käytetty määrä sekvensointi . Tämä näyttää ( yhteensä kohdennettu emäkset ) ( tarkoittaa sekvensointi kattavuus ) /( rikastus hyötysuhde ) = määrä sekvensointi .
3

Kytke 62 MB "total kohdennettuja perustaa" ja 0,65 " rikastamiseen tehokkuutta . " Lisääsekvensointi kattavuus määrä 50x jayhtälö näyttää (62) (50) /0.65 . Yhtälön tulos on 4,8 gigatavua Sekvensointitiedot .