3DS ja 2DS käyttävät eri kasetteja. Vaikka jotkin 3DS-pelit saattavat toimia 2DS:ssä, päinvastoin ei pidä paikkaansa.
Tässä syy:
* Eri patruunakoot: 3DS-kasetti on hieman suurempi kuin 2DS-kasetti.
* Laitteiston yhteensopivuus: 3DS:llä on erilainen laitteistoarkkitehtuuri kuin 2DS:llä, ja pelit on suunniteltu erityisesti vastaaville laitteille.
Siksi 2DS-pelikasetin asettaminen 3DS:ään johtaa todennäköisesti siihen, että kasetti ei sovi kunnolla eikä järjestelmä tunnista sitä.