Tässä syy:
* Eri laitteistot: 3DS:ssä on tehokkaampi laitteisto kuin DS:ssä, mikä mahdollistaa monimutkaisempien pelien ja grafiikan. Tämä ero laitteistossa vaatii erilaisia pelikasetteja.
* 3D-ominaisuudet: 3DS:n pääominaisuus on sen kyky näyttää 3D-grafiikkaa, mikä DS:ltä puuttui. Tämä vaatii erityisiä ohjelmistoja ja laitteistoja, jotka eivät ole yhteensopivia vanhempien DS-pelien kanssa.
* Eri ohjelmistot: 3DS toimii eri käyttöjärjestelmällä kuin DS, mikä tarkoittaa, että DS-pelit eivät ole yhteensopivia 3DS:n kanssa.
Jotkut 3DS-pelit ovat kuitenkin taaksepäin yhteensopivia ja voivat pelata DS-pelejä. Nämä ovat tyypillisesti "DSiWare"-pelejä, jotka ovat digitaalisia pelejä, jotka julkaistiin DSi:lle, DS:n mallille, jossa on hieman parannetut ominaisuudet.
Joten vaikka 3DS:llä ja DS:llä on joitain yhtäläisyyksiä, niiden pelikirjastot ovat erilaiset näiden kahden konsolin välisten teknisten erojen vuoksi.